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Les principaux thèmes de recherche de notre laboratoire portent sur :
 
L'exploitation des différents effets bénéfiques des bactéries comme les Pseudomonas et  les Bacillus  dans l'agriculture de notre pays. Cette étude aura pour objectif l'essai de  l'utilisation de souches saprophytes et endophytes appartenant aux groupes des Pseudomonas fluorescents et des Bacillus et isoler à partir des rhizosphères de plantes cultivées à grande échelle.
  
La connaissance des symbioses entre plantes et microorganismes, en particulier chez les légumineuses et sélection de souches microbiennes élites pour la production d'inoculant agricoles ou horticoles pour l'amélioration de la production végétale.
L'étude des mécanismes de réponses de diverses espèces végétales cultivées et/ou spontanées aux stress abiotiques (stress hydrique et salin),le stress oxydatif induit par tout type de contraintes et aux xénobiotiques (pesticides et hydrocarbures). Ces études visent les aspects morphologiques, physiologiques, métaboliques et  moléculaires à différents stades du développement du végétal. Elles visent aussi à déterminer les mécanismes de signalisation induisant la biosynthèse des flavonoides et le type de molécules flavonoiques impliqués dans la résistance des plantes aux stress.
  
L’extraction et valorisation des substances naturelles locales et plus particulièrement certains composants bioactifs des végétaux et des plantes médicinales traditionnelles utilisés en phytothérapie dans la prévention contre certaines maladies chroniques telles que le diabète, maladies cardiovasculaires. L’étude des propriétés chimiques a permis de mettre en évidence les molécules bioactives contenues dans la plante, de les extraire et de les identifier.